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MIMIC + eICU · 使用说明

材料准备、系统条件与详细研究说明

数据与研究起点

完整本地包

历史交付说明包含程序与 MIMIC-IV 3.1 hosp 22 表、icu 9 表及 eICU CRD 2.0 的 31 表,共 62 张核心压缩表;实际版本和适用系统以发布包为准。受限数据须满足原数据库使用要求。

问题决定提取

现有映射以数值实验室及有限人口学信息为基础。新疾病表型、诊疗定义或变量需要具体适配,表存在不代表临床定义已内置。

从临床问题到研究交付

01提出临床方向

结合真实文献和相反证据,比较少量候选及增量,不按最大 OR 或最高 AUC 选题。

02核定双库可行性

确认患者与住院层级、观察界点、单位、时间可用性、结局和缺失规则。

03冻结方案后分析

绑定方案、提取规则与输入;变更定义时新建版本,保留原结果。

04解释、写作和修订

先读样本流程与主要结果,再把聚合事实、图表和文献接入待审 Word。

关键是把时间说清楚

预测特征须在约定观察界点前可获得;采样时间与记录可用时间分别核对,未测量保留缺失,不能填成正常值。

方法覆盖与交付成果

原生路线与适用含义

关联分析

普通 logistic MLE 与患者聚类稳健推断;按已声明阈值、调整变量和完整病例计算分库 OR,无法可靠估计时保留状态。

固定迁移预测

L2 logistic 在 MIMIC 患者拆分后训练,冻结插补、标准化与模型再用于 eICU,报告区分度、Brier 与校准等。

规则分窗轨迹

用 2 至 8 个不重叠窗口的中位数和预定净差分组;描述上升、下降或净差小,不等于潜类轨迹或疾病诊断。

固定 KMeans 分型

训练来源学习预处理与质心,内部及另一来源固定赋型,给出类规模、特征分布与偏移摘要。

医院退出竞争事件

原因别 Cox 与 Aalen–Johansen,限定记录死亡退出和存活退出;不追踪存活出院后的事件。

专题适配与续作

已有肌酐样条等专题实现按对应方案使用;新模块需登记和核对,不能泛化成任意算法已就绪。

方案

人群、窗口与定义

聚合表图

按分析族生成

Word 草稿

结果与文献对应

版本续改

保留结果与旧稿

准备好环境,再开始研究

Windows 与 Apple Silicon Mac 使用各自完整包。Windows 含 Python 与 122 个离线 wheel,准备流程需要 PowerShell 7;Mac 使用合格本机原生 Python 和项目局部依赖。首次由 Agent 检查。

研究者审阅与使用条件

数据访问资格与使用协议需单独满足。跨库迁移结果不等于临床部署验证;医院退出代理不是出院后全因生存。合成流程测试不替代真实研究、统计与临床审核。

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